降临在神奇宝贝世界之中的领袖者，带着系统踏上了获得道馆徽章，征服各大地区的旅程。 随着领袖者的征战，各大势力也随之浮现，十七大神奇宝贝家族各御一方，正义势力——神奇宝贝联盟与邪恶势力——火箭队的激战不断展开，一个个隐藏的势力也不断出世。 一只只神兽也随之出现，联合演奏出一场远古的厮杀之战...............