哪吒在陈塘关过着平静生活，直到体内灵珠突然暴走，揭示出他并非简单的魔丸转世，而是被刻意调换的灵珠载体，隐藏着更深的秘密。哪吒在追寻真相过程中遇到自称"灵族"后裔的少女碧瑶，她掌握着与哪吒同源的灵力，两人共同揭开千年前灵族被天庭剿灭的历史。